BioCloud: Um Framework para Execução Eficiente de Aplicações de Biotecnologia em Múltiplas Plataformas da Nuvem AWS
Coordenadora: Alba Cristina Magalhães Alves de Melo
O presente projeto de pesquisa visa resolver o problema de alocação e gerência de recursos na nuvem Amazon AWS para aplicações HPC de biotecnologia, minimizando o tempo de execução e maximizando a disponibilidade, sem violar acordos de SLAs, de modo a executar aplicações eficientemente e com custos financeiros menores para o usuário. Nesse sentido, serão consideradas tanto instâncias permanentes (on demand) como transientes (spot), bem como múltiplos tipos de recursos computacionais (CPU, GPU e FPGA), aumentando o leque de alternativas explorado.
O uso coordenado destas múltiplas instâncias será gerenciado numa forma dinâmica e autônoma. Neste sentido, será investigado o uso de agentes inteligentes para auxiliar nas decisões de elasticidade (tanto horizontal quanto vertical). Em termos do modelo de computação em nuvens públicas, além do uso só de máquinas virtuais, será estudado a viabilidade do uso de containers dentro das instâncias em comparação com implementações utilizando os serviços de containers e de kubernetes já oferecidos pelo próprio AWS e o conceito de serverless computing com AWS Fargate versus AWS Lambda. Porém, as diferentes abordagens, tecnologias, e instâncias estarão “escondidas” do usuário final através de um gateway científico (portal web) com um gerenciador de workflows atrelando os recursos necessários da nuvem.
Equipe
Universidade de Brasília (UnB)
Alba Cristina Magalhães Alves de Melo
Célia Ghedini Ralha
Maria Emília Machado Telles Walter
Aldo Henrique Dias Mendes
Carlos Antônio Campos Jorge
Eduardo Scartezini Correia Carvalho
Gustavo Jardim Portella
Helena Schubert da Incarnação Lima da Silva
Marco Antonio Caldas de Figueirêdo Júnior
Universidade Federal Fluminense (UFF)
Eugene Francis Vinod Rebello
Lúcia Maria de Assumpção Drummond
Maria Cristina Silva Boeres
Alan Lira Nunes
André Fernandes Gonçalves
Gustavo Muller Moreira
Luan Teylo Gouveia Lima
Mario João Junior
Pablo Moreira Cavalcante de Carvalho
Rafaela Correia Brum
Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
Alexandre da Costa Sena
Cristiana Barbosa Bentes
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
