BioCloud (CNPq/AWS)

BioCloud: Um Framework para Execução Eficiente de Aplicações de Biotecnologia em Múltiplas Plataformas da Nuvem AWS

Coordenadora: Alba Cristina Magalhães Alves de Melo

O presente projeto de pesquisa visa resolver o problema de alocação e gerência de recursos na nuvem Amazon AWS para aplicações HPC de biotecnologia, minimizando o tempo de execução e maximizando a disponibilidade, sem violar acordos de SLAs, de modo a executar aplicações eficientemente e com custos financeiros menores para o usuário. Nesse sentido, serão consideradas tanto instâncias permanentes (on demand) como transientes (spot), bem como múltiplos tipos de recursos computacionais (CPU, GPU e FPGA), aumentando o leque de alternativas explorado.

O uso coordenado destas múltiplas instâncias será gerenciado numa forma dinâmica e autônoma. Neste sentido, será investigado o uso de agentes inteligentes para auxiliar nas decisões de elasticidade (tanto horizontal quanto vertical). Em termos do modelo de computação em nuvens públicas, além do uso só de máquinas virtuais, será estudado a viabilidade do uso de containers dentro das instâncias em comparação com implementações utilizando os serviços de containers e de kubernetes já oferecidos pelo próprio AWS e o conceito de serverless computing com AWS Fargate versus AWS Lambda. Porém, as diferentes abordagens, tecnologias, e instâncias estarão “escondidas” do usuário final através de um gateway científico (portal web) com um gerenciador de workflows atrelando os recursos necessários da nuvem.


Equipe
Universidade de Brasília (UnB)
Alba Cristina Magalhães Alves de Melo    
Célia Ghedini Ralha    
Maria Emília Machado Telles Walter  
Aldo Henrique Dias Mendes    
Carlos Antônio Campos Jorge    
Eduardo Scartezini Correia Carvalho  
Gustavo Jardim Portella    
Helena Schubert da Incarnação Lima da Silva    
Marco Antonio Caldas de Figueirêdo Júnior  
Universidade Federal Fluminense (UFF)
Eugene Francis Vinod Rebello    
Lúcia Maria de Assumpção Drummond    
Maria Cristina Silva Boeres    
Alan Lira Nunes    
André Fernandes Gonçalves  
Gustavo Muller Moreira  
Luan Teylo Gouveia Lima    
Mario João Junior  
Pablo Moreira Cavalcante de Carvalho  
Rafaela Correia Brum  
Universidade do Estado do Rio de Janeiro (UERJ)
Alexandre da Costa Sena    
Cristiana Barbosa Bentes    
Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA)
Marcos Mota do Carmo Costa  
Natalia Florencio Martins    
Priscila Grynberg  
Roberto Coiti Togawa    

Publicações